È nato nel 1975 a Deggendorf, Baviera. Fin da giovanissimo scopre il mondo dell'organo grazie a Wolfgang Riegraf e Roland Götz studiando in seguito Musica da Chiesa a Regensburg con Karl Friedrich Wagner e a Friburgo con Klemens Schnorr.

Intraprende quindi gli studi di Musica Antica presso la Schola Cantorum Basiliensis diplomandosi " Cum Laude" in Organo e Clavicembalo sotto la guida di Andrea Marcon e di Gottfried Bach per il Basso Continuo. Ha inoltre frequentato numerosissimi corsi di specializzazione in tutta Europa, tenuti da celebri docenti ed interpreti, approfondendo così lo studio di tutto il repertorio organistico sempre con una particolare attenzione e predilezione per gli strumenti storici.

È stato premiato in numerosi concorsi internazionali ( Innsbruck, Nürnberg, Landau) e nel 2000 ha vinto il primo premio assoluto a Bruges.

Dal 2001 al 2005 collaborava regolarmente come organista e clavicembalista con l'Orchestra Barocca di Venezia diretta da Andrea Marcon.

Dal 2002 Lindner è incaricato come musicista di chiesa a Basilea ed è insegnante di Basso Continuo e Cembalo complementare presso la Schola Cantorum Basiliensis.

Inoltre dal 2004 al 2016 è stato professore incaricato per l'organo e l'improvvisazione presso l' Accademia Superiore di Hannover. Da marzo 2016 è professore d'organo presso la Schola Cantorum Basiliensis.